Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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