Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ZBED1O96006 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ZBED1O96006 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ZBED1O96006 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ZBED1O96006 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ZBED1O96006 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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ZBED1O96006 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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