Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.4 ms