Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms