Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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