Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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