Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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