Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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