Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HTR4Q13639 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms