Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLN3Q13286 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLN3Q13286 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLN3Q13286 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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