Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms