Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms