Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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