Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms