Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms