Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNCP24821 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNCP24821 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNCP24821 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNCP24821 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNCP24821 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNCP24821 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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