Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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