Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HDGFL3Q9Y3E1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HDGFL3Q9Y3E1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HDGFL3Q9Y3E1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HDGFL3Q9Y3E1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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