Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms