Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms