Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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