Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms