Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOFQ13790 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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