Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1AQ13111 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms