Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCA2P51587 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms