Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms