Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms