Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms