Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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