Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC6Q9UBN7 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms