Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms