Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms