Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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