Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms