Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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