Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms