Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms