Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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