Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL1Q13616 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL1Q13616 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL1Q13616 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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