Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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