Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM28Q13263 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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