Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms