Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms