Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms