Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms