Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PSMB5P28074 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms