Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms