Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYN1P17600 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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