Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP2AP11388 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms