Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFNB1P01574 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFNB1P01574 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNB1P01574 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNB1P01574 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNB1P01574 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNB1P01574 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms